甲状腺球蛋白抗体大于1000可以通过饮食调理、药物治疗等方式进行治疗，具体分析如下：
甲状腺球蛋白抗体大于1000表面指数偏高，甲状腺球蛋白抗体指数的上升在自身免疫性甲状腺疾病中是常见的。最常见的是桥本甲状腺炎，有些甲状腺功能亢进症的病人也会出现增高的情况，要结合甲状腺功能和彩超来判断。如果只是单纯的增加，一般不需要特殊治疗，但是桥本甲状腺炎会导致甲状腺功能下降。如果是甲状腺功能亢进症，可以考虑使用抗甲状腺功能亢进的药物。桥本甲状腺炎的发生，与高碘饮食有一定的关系，因此，无论甲状腺功能亢进症或桥本甲状腺炎，都要适度地控制食用海鲜和碘盐。