先天性甲状腺机能低下是指由于新生儿的遗传变异引起的，引起的甲状腺激素下降。先天甲亢的症状是儿童的生长和智商下降，大部分儿童在一开始的时候体长基本在正常的水平，到了出生后，其身高的增长和身体的重量都会下降。
此外，由于甲状腺激素在神经系统的发展中扮演着非常关键的角色，所以如果甲状腺激素不足，则会对智商造成一定的损害。还有一些先天的甲状腺功能低下，会出现一些其它的异常，比如心脏的异常，比如泌尿系统的异常。