由于自身免疫性甲状腺炎一般不会出现明显的临床表现，主要是由于甲状腺的功能是正常的，因此，只要身体机能还算健康，那么妊娠并不会受到太大的影响，也不用太过于担忧是否会出现甲减，一旦出现了20%的可能性，那么要尽快的进行治疗，避免出现甲减的低潮。因此自身免疫甲状腺炎的患者也可以怀孕。
怀孕后，患者要注意定期孕检。