一般情况下，桥本甲状腺炎甲减主要通过服用左甲状腺素治疗。
桥本甲状腺炎是一种自身免疫性疾病，目前并没有研发出针对病因治疗的药物，主要是支持和对症治疗，保持甲状腺的功能，控制并发症，限制碘盐摄入可能有助于减缓甲状腺组织的破坏。
当出现甲状腺功能减退时，可以给予左甲状腺素治疗，可以改善甲状腺激素的缺乏。