取卵是一个小手术，可以是在全身麻醉下或是在局部麻巢下进行。经阴道超声仪引导，将取卵针穿过阴道，直达卵巢吸取卵子后，实验室人员立即在显微镜下将吸到的卵子移到含有胚胎培养液的培养皿中，置于37℃的培养箱中培养。由于阴道内超声波吸入术是一种小手术，有些医生为了让患者节约费用只使用止痛药而不使用全身麻醉。