怀孕40天的时候，B超检查可以看到妊娠囊，并且在妊娠囊内可以看到卵黄囊。如果月经周期比较短的情况下，比如25天1次月经周期，在孕40天的时候B超检查，很可能会看到胚芽。如果在40天B超检查的时候看不到卵黄囊，建议5天或者1个星期之后再做B超检查。如果仍然看不到卵黄囊，建议抽血监测血HCG，并且隔1天再检查1次，主要观察血HCG是否在原来的基础上翻倍上升。如果没有翻倍上升，考虑胚胎停止发育的可能。