病毒性脑炎会有后遗症的，病毒性脑炎如果未及时治疗，会影响脑部脑实质，导致神经元出现坏死，从而残留有一些偏瘫，智力发育障碍等后遗症。出现偏瘫或者肌肉无力等后遗症，多是损伤脑部神经元所支配的肢体不能正常进行活动。这种后遗症没有特效药物进行治疗，只能持续多加进行康复锻炼，通过锻炼恢复肢体正常运动功能。