病毒性脑炎后遗症，有失语、语言迟钝、瘫痪、吞咽困难、耳聋、癫痫等神经系统的损害。有痴呆、智力低下、表情淡漠、眼神呆滞、攻击性行为、认知功能异常。有多汗、流涎等自主神经的功能失调。细菌性脑膜炎的后遗症比较严重，包括意识障碍、双侧听力丧失、运动障碍、癫痫、脑积水。有的病人症状比较轻微，遗留较轻的后遗症，包括行为问题、学习困难、肌张力降低、复视。