迄今为止，儿童抽动症的具体病因不清。学者和专家认为：抽动秽语综合征、慢性运动或发声抽动障碍以生物学因素，特别是遗传因素为主要病因，短暂性抽动障碍可能以生物学因素或心理因素之一为主要发病原因，也可能是两种因素均有。如果是以生物学因素为主者，容易发展成慢性抽动障碍或抽动秽语综合征，若以心理因素为主，则可能是暂时性的应激或情绪反应，在短期内自然消失。