流脑疫苗自费免费区别是免费流脑疫苗是A群流脑疫苗，只用于预防A群脑膜炎球菌引起的流行性脑脊髓膜炎，而自费的流脑疫苗是A+C群流脑疫苗，这种疫苗可用于预防A群及C群脑膜炎球菌引起的流行性脑脊髓膜炎，自费疫苗预防的病毒种类更多一些。