短肠综合征的治疗目的就是补充营养和纠正水电解质紊乱以及酸碱失衡，并且要防止营养支持的并发症，供给肠内营养以获得残留小肠的代偿。肠外营养主要是补充肠内营养的不足，一般根据三个阶段，也就是急性期、代偿期和维持期的不同特点来进一步调整和纠正治疗的方案。