在临床上，对于出生体重低于2公斤的新生儿，或者是早产儿，有惊厥、皮肤病变、体温调节功能异常等，都要在医生的指导下将其放入保温箱内。
通常情况下，早产儿或者是出生体重过轻的新生儿，因为的身体各个系统都没有发育好，因此要在保温箱内保持温暖。
由于保温箱可以模拟宫内环境的温度和湿度，对保温箱内的温度和湿度进行调整，有些保温箱还可以起到遮光的作用，这样可以降低光线对新生儿的刺激。保温箱可以隔绝外界的声音，减少外界声音对新生儿耳朵的刺激，提高新生儿的安全感，对新生儿的成长和发育有好处。如果新生儿的体重增加到2kg以上，就不需要使用保温箱了。
同时，对于有疾病的新生儿，也要把新生儿放在保温盒里。如果新生儿有皮肤病变，要进行系统用药，要注意观察皮肤损害的变化，如果是高胆红素血症，需要蓝光照射，或者是惊厥发作的新生儿，不能自主调节体温，将其放在保温箱中，既可以保暖，又可以让医生更好地观察新生儿的病情变化。