父亲携带乙肝病毒，传染给新生儿的机会是存在的，但现在孩子生下来后都常规注射乙肝疫苗，所以，感染的机会就非常小了。所以，只要按期将剩下的一只乙肝疫苗注射完即可。小孩子只要到正规的医院是都可以检查乙肝两对半的，如果没有患有乙肝建议尽快接受乙肝疫苗。