肠道内的感染由细菌和病毒造成，特别是致病性大肠杆菌，是主要的致病菌。假如孩子有病而大量不合理地使用抗生素，还会造成霉菌对胃肠的侵犯。不合理地喂养婴幼儿，孩子吃得过多，过少；或过早、过多吃淀粉类、脂肪类食物；突然改变食物，突然断奶等，都能引起孩子拉肚子。