自身免疫性脑炎根据疾病轻重程度的不同，而不一样。如NMDA脑炎，死亡率和致残率较高，如未尽早识别、诊断，未给予相应免疫治疗。已经发现多种具有神经毒性并可引起神经系统损伤的抗体。脑炎的治疗包括肿瘤切除和免疫治疗在内的联合治疗，发现肿瘤并尽早切除是治疗该病的关键。