儿童发生甲减的原因最常见的原因是由于先天性的缺陷，造成合成甲状腺激素的一些酶的缺乏，使甲状腺激素的合成发生障碍。其次是可能孩子摄入碘不足引起，还有就是免疫功能减退，免疫力降低引起的。无论是哪种原因导致的甲减，一旦确诊均需要进行替代性的治疗，以免影响孩子的生长发育。