怀孕3个月流产是多方面引起的，具体分析如下：
染色体异常、环境因素、病毒感染、免疫因素、局部结构异常等。这些都会使胎儿发育异常甚至导致胎儿流产。建议备孕前夫妻双方进行孕前的优生检查和病毒检查，比如风疹病毒、弓形虫、单纯疱疹病毒、巨细胞病毒等。
建议患者前往医院进行专业性检查，明确流产原因，方便进行治疗。