使用左旋肉碱减肥药可能会引起不良反应，肝肾功能弱的人服用左旋肉碱时经常出现不良反应，过量使用左旋肉碱可能导致腹泻。
左旋肉碱燃烧脂肪并提供能量，这也使人兴奋。因此，服用左旋肉碱可能会导致失眠并影响睡眠质量。如果长时间服用左旋肉碱，高消耗和低摄入会导致营养不良，从而降低身体功能。左旋肉碱可能对肌肉有害，导致肌肉无力、肌肉萎缩等。