清热化毒丸通常不能祛痘，如果想要去除痘痘，通过外用药物或者激光治疗。
清热化毒丸能够起到消肿止痛和清火化毒的功效，通常可以改善咽喉肿痛或者口舌生疮现象，因此并不能治疗痘痘。长痘痘可能是细菌感染或者炎症刺激引起的，根据医生指导外用药物治疗，比如红霉素软膏、盐酸克林霉素软膏。
长痘痘还可以通过激光调整，利用性光热原理调节波长和脉宽能量，能够抑制痤疮难以生产的多皮质，还可以杀死痤疮中的多种细菌，具有很强的功效，达到去除痘痘作用。