脑炎一般2-4周即可痊愈，如果遗留不同程度的肢体运动障碍、智力发育障碍、语言功能丧失以及吞咽困难等各种后遗症者，应尽早进行康复治疗。六个月内，尤其是三个月内开始正规治疗，可以明显的提高患儿的智力运动、言语发育的水平，大部分可以临床治愈，改善预后，并最终避免或者降低伤残程度。如果六个月后仍有严重的后遗症者，则预后比较差，某些后遗症则需要终身治疗。