脑炎进行医治后病情加重是因为炎症损害脑神经所致的神经功能不全紊乱，病毒性脑炎可以通过激素抗炎疗法和脱水疗法使病毒抑制，炎症控制后不能恢复各种功能是炎症损害的神经仍出于麻痹不全状态，由于神经功能障碍不能支配调节本身的血供，造成症状加重。