许多肾囊肿性疾病与遗传和先天因素有关，如多囊肾、髓质海绵肾、肾多房性囊肿等，统称为先天性肾囊肿。由于单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，因此不需治疗，只要六个月到一年随诊。如果囊肿直径较大，超过五厘米或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术并囊内注射硬化剂。如果囊肿巨大，直径超过十厘米则可能需要手术治疗。