简单来说，颅咽管瘤均为良性。
但在形态上颅咽管瘤可分为3类：
第一类为肿瘤细胞组成的实性肿瘤。
第二类为肿瘤部分由实质性肿瘤细胞组成，另外一部分为囊性、囊液。
第三类为肿瘤包括实质性，囊性和局部钙化肿瘤，因此肿瘤成分种类繁多。
但颅咽管瘤均为良性。因此颅咽管瘤具有囊性，实质性和钙化。肿瘤性质不同对周围组织有不同作用。例如囊性颅咽管瘤肿瘤虽较大，但对周围组织（包括视神经压迫）可影响较小。实质性肿瘤受压视神经较囊性肿瘤受压视神经可导致更重症状。也就是说囊性颅咽管瘤较少压迫周围组织。