一般来说，外伤并非脊髓纵裂病因，现在通常认为脊髓纵裂是先天性疾病。脊髓发生于母体妊娠初期，也就是胎儿形成初期。由于多种病因干扰。脊髓发育发生了问题。形成了双干脊髓（脊髓分支）。
常常会发生这样的事情，家族中如姑姑生病、侄子、外甥生病，都会发生这样的现象。另一种是同代之内，如兄弟患此病，兄弟生病只见于文献报道记载，而儿童医院数千例患者尚无记载，故此种遗传只表现为遗传趋势、发病趋势，而非当代人生病、后辈生病，此种可能性较小。