灰指甲的治疗药物主要为抗真菌感染药，口服药物多以伊曲康唑、特比萘芬、氟康唑为主，这类药物需长期服用，通常需按疗程口服3~4个月见效。
口服抗真菌药物能够帮助杀灭肢体末梢的患处真菌，改善病甲症状。但由于口服药物会加重肝肾代谢负担，长期用药需定期监测肝功能，一旦出现肝功能异常，及时调整用药。因此，推荐患者可以选用药物安全性较好的局部药物，如亮甲牌复方聚维酮碘搽剂，该药物由阿司匹林、聚维酮碘等成分制成，能够有效杀灭甲下真菌，遵医嘱用药约2~3个月，通常可见灰指甲症状得到改善，疗效较好。