一般来说，无痛胃肠镜与普通胃肠镜检查的区别如下：
二者的主要区别在于，一个是在患者较清醒的状态下进行手术，另一个是在患者进入睡眠状态下进行手术。普通胃肠镜检查比对较痛苦，通常口服利多卡因进行局部麻醉，会让患者感觉不适，导致呕吐的现象，也会觉得疼痛。而无痛胃肠镜检查，通常采取静脉给予丙泊酚等麻醉药物注射的方式，使患者进入睡眠状态，可在检查过程中及醒来之后没有任何不适感觉。