对于慢性胃炎来说，益生菌并不能起到治疗粘膜炎症的作用。
大部分的益生菌，包括大肠杆菌、双歧杆菌等，都能起到调节人体肠道菌群平衡的作用。幽门螺旋杆菌感染会导致胃炎，而益生菌并不能调节、抑制和杀灭这些细菌。慢性胃炎患者可以口服一些保护胃粘膜的药物、抑酸药物、抗生素等。在治疗期间，患者要注意饮食健康，避免进食辛辣刺激、油腻、高甜类食物。