幽门螺旋杆菌是慢性胃炎合并幽门螺旋杆菌的首选药物。可以在医生指导下口服奥美拉唑、枸橼酸秘钾、2种抗生素如阿莫西林、甲硝唑等药物，在服药2周后停止使用C14呼气试验检测幽门螺旋杆菌。
如果是慢性胃炎，可以通过服用硫糖铝等胃粘膜保护剂来保护胃粘膜，减少胃酸等因素对粘膜的损害和刺激；可以通过服用多潘立酮来促进食物的消化和吸收。要经常做好胃镜检查，避免病情进一步加重。