肠胃炎主要是由感染性和非感染性引起的，细菌感染、病毒、真菌、寄生虫等是引起肠胃炎的主要因素。非感染的原因主要有：胆汁或胰液反流、非甾体消炎药物、食物过敏、自身免疫系统失调等。
另外，由于慢性、非特异性的肠炎，如溃疡性结肠炎、克罗恩病等。出现急性肠胃炎的时候要注意鉴别病因，排除病因，对症治疗，平时要注意清淡、易消化、富含维生素的食物，不要吃辛辣刺激性的食物。