通常情况下，胃病是导致夜间胃反酸的主要原因，主要有胃炎、胃体癌、糜烂性胃炎、胃息肉等。
胃上部的黏膜组织在疾病的刺激下，会发生外伤性损害或者是侵袭性的损害。当病变部位与胃酸接触时，会引起平滑肌的收缩。当体内的压力增大时，胃液会回流到食管、口腔等部位，引起反酸、恶心、呕吐等不良反应。晚上的时候，胃是比较空的，如果胃酸增加，会导致反酸加重，也有可能是十二指肠溃疡、胰腺炎、胆囊结石等疾病。由于上述器官与胃部的联系，如果发生了疾病，不但会导致胃的正常运转，还会导致肠胃的不舒服。