胃食管反流病的治疗要看病情轻重。轻度的患者可以选择多潘立酮等促进胃肠动力的药物。对于轻度或中等的患者，可以选择法莫替丁等H2受体拮抗剂，治疗时间为8-12周。
病情较重的患者可以服用奥美拉唑等质子泵抑制剂，治疗4~8个星期。质子泵抑制剂和H2受体拮抗剂均属于抑酸类，而质子泵抑制剂的效果优于后者。如果是处于亚健康的患者，可以根据患者的感受来选择治疗。