一般情况下，新生儿肠炎是由于小儿的肠道粘膜屏障功能差，在进食时，不洁食物进入就会感染肠道的炎症。
一般母乳喂养的孩子，增强肠道免疫力的抗体，在母亲乳汁含有，所以患肠炎的概率比较小一些。但如果卫生没有注意，或者奶瓶没有清洁、消毒，冲调奶粉时间过长，也是有可患肠炎的可能性。建议去医院进行大便常规检查，已确定是否是肠炎，当患了肠炎，建议使用敏感的抗生素治疗，在恢复身体健康后，及时补充肠道微生态制剂。