一般情况下，新生儿侵袭性大肠埃希菌肠炎的治疗方法主要是对症进行药物治疗，及时补充水、电解质等液体，使酸碱达到平衡，不再紊乱。这个病需要自然治疗的时间在一周左右，新生儿则需要短期进行治疗。药物治疗的方法具体如下：
1、新生儿出现严重的腹泻、脱水、电解质紊乱等症状，为了使新生儿的水电解质达到平衡，需要进行静脉补液盐，没有脱水症状后，为了使丢失和生理消耗量得以补充，每天的液量还需要继续；
2、新生儿出现比较严重的腹痛、腹泻症状时，建议使用蒙脱石散、阿托品、山茛菪碱、普鲁本辛等止泻止痛的药物。