大肠杆菌的检验方法有很多。如果通过大便检查检出患者，则认为患者是因为大肠杆菌过度繁殖而感染肠道，一般会出现腹泻、消化不良等症状。建议患者使用抗生素进行抑菌治疗。常用药物包括氨苄西林、庆大霉素、头孢菌素等药物。
如果是通过血液、尿液、脑脊液等部位取出，也认为是这部分大肠杆菌感染引起的，需要根据病情进行特定的抗菌治疗。