脑脓肿的手术费用必须视具体情况而定。
脑脓肿的患者一般都选择采取二次或者多次脓肿穿刺抽液等方法来对其病情加以改善。由于对脑脓肿的手术而言，既有单发脓肿，也有多发脓肿，一次脓肿抽吸手术约需3万元~4万元。如果患者患有多发性脑膜脓疱，那么其感染面积可能更大一些，在这种情况下，选择再次手术来治愈或者切除病灶，成本将会更高。而在一些场合，脓肿亦可复发，未必一次根治，此亦为脑脓肿治疗中很重要之因素。另外还有一些人认为在医院里面花费了那么多资金，如果不及时治疗可能对身体造成很大的危害，甚至危及生命。
此外，当地消费水平、患者选择的医院等因素也可能会影响费用多少。