脑干损伤会导致交叉性瘫痪，这是因为人体的大脑对身体的控制是相对的，也就是对面的身体要将信号传递到对面的大脑，或者对面的大脑将信息传递到对面的身体。这个讯号的传递，必须要在脑干内完成，才能进行不同的讯息传输。这种生理结构决定了当颅内损伤到脑干时，会导致信号传导障碍，从而导致交叉瘫痪，也就是病灶对侧的外周性脑神经麻痹和对侧的中枢性偏瘫。