脑炎病灶消不掉可以通过以下方式进行治疗：
1.药物治疗：患者可以在医生指导下使用阿昔洛韦、更昔洛韦等药物进行治疗。
2.高压氧治疗：可以迅速纠正脑组织缺氧，减轻脑细胞水肿，进而降低颅内压；还可以降低氧自由基的生成，减轻血管再次损伤，最终达到改善患者临床症状及体征，减少或预防后遗症发生的作用。
病情恢复期间，患者应卧床休息。