排除脑膜炎，脑炎，须与病人病史相结合，对应体格检查和对应辅助检查才可排除。
对于脑实质疾病，尤其是在婴幼儿时期发病的患儿，就需要特别注意。普通脑膜脑炎病人可有发烧，头痛，恶心等症状、呕吐和癫痫。在诊断上需要根据临床特征来判断是否为脑膜炎或是脑炎。若病人不出现上述症状，并经过相关辅助检查。
例如说，进行头颅磁共振平扫+强化颅内，同样无病变，或腰椎穿刺脑脊液检查，脑脊液检查显示压力正常，脑脊液内细胞数量较多、蛋白数及糖，氯化物含量均正常，也有相应病毒抗体存在，自身免疫性抗体或存在结核杆菌感染所引起的此类抗体均属正常。通常情况下，脑膜炎和脑炎均可排除。