真菌性脑膜炎的治疗的确是比较复杂，由于真菌一穿过血脑屏障，处理较为困难。临床上对于此类疾病可以采用药物进行干预和预防，但是也不能忽视了对其预后的判断，尤其是早期诊断以及时治疗至关重要。病人表现为精神症状体征，可在脑实质内出现累及，后期极有可能使大脑发生不可逆损伤，因此，一旦发生不可逆损害，应不可能在痊愈，仅能控制或推迟病症的恶化。