流脑的病情复杂多变，轻重不一。表现为四个临床类型：
90%的患者是普通型，症状有寒战、高热、头痛、身痛、恶心、易怒、面无表情等。由于颅骨缝、囟门未闭，小儿的脑膜炎症症状多为不典型，主要有高热、呕吐、眼睛直、不吃奶、尖叫声、抽搐等症状。
二是爆发性，这种情况在儿童中比较常见，如果不能及时治疗，24小时后就会死亡。这种类型有休克、脑膜炎、混合型三种。休克型主要以中毒、低血压、休克、瘀点瘀斑为主，快速融合。脑膜脑炎型的主要症状是抽搐、迅速昏迷，最后出现脑疝、呼吸衰竭，而休克型和脑炎型则是混合型，死亡率很高。
三是轻度，轻度发热，上呼吸道感染，轻微头痛、咽痛等，只有极少数微小的出血。
四是慢性脓毒症，这是一种少见的疾病，主要发生在成年人身上，持续几个月的时间，症状为发热、皮疹和关节疼痛。