片断性肌阵挛的鉴别如下：
一、正常睡眠正常人在睡眠时发生肌阵挛为常见生理现象，多见于睡眠期始时及快速眼动相睡眠此期，连续非快速眼动相睡眠，肌阵挛正常人均少见。
二、周期性的肢体运动障碍，常表现为肢体的周期性、刻板性和重复运动，它的潜伏期较长，睡眠期偶可见到周期性的肢体运动，这是因为多种肌肉的爆发性和短暂性，抽搐导致多肌发生阵挛。
三、短暂快速眼动相睡眠时肌阵挛发作，它仅限于快速眼动相的睡眠期，典型症状为肌阵挛，持续5~十五秒，常伴有眼球短暂而迅速运动或心波动、呼吸不正常。