大脑是通过以下方式控制意识的：
意识状态是人在认识和感知周遭环境、自己的状况时所具有的一种能力，它是一种由高层次的神经中枢的功能活动所形成的。清醒意识的维持有赖于大脑皮层的兴奋，脑干的上层网状活化系统接收来自不同的感官讯息，并从脑干传到丘脑的非特异性核团，然后扩散到脑皮层，使得整个脑皮层都处于亢奋状态，并持续处于唤醒状态。上位性网状活化系统或两侧大脑皮层的损伤都会引起意识障碍。意识障碍主要表现为意识层面的降低和意识内涵。