自身免疫性脑炎的早期症状多，与其所在的中枢神经系统相关，其临床表现为精神和行为的不正常。
亚急性发作的临床表现以认知功能障碍、精神失常为主，表现为幻觉、幻听、亢奋、意识下降、说话不清楚等，临床上往往与自身免疫性脑炎相混淆。自身免疫性脑炎需要密切关注患者的自身免疫状况，以及治疗的效果，同时还要注意观察患者有没有什么后遗症。自身免疫性脑炎需要结合病史、体格检查、脑脊液等方面的检测。