一般来说，引起心源性脑栓塞的原因较多，具体如下。
心源性脑栓塞时栓塞多发生在大脑中动脉，是指来自心脏的栓子阻塞脑中的动脉血管所致。心源性脑栓塞大多发生在有高血压、高血脂或心脏病史的病人之中。一般心房颤动是心源性脑栓塞的常见原因，由于心房颤动时左心房收缩性降低，血流速度减缓，可能导致附壁血栓、栓子等脱落，进而引起脑栓塞。心脏瓣膜病也可能会引起心源性脑栓塞，心脏瓣膜病可能会影响血流，导致附壁血栓的形成，进而引起心源性脑栓塞。心源性脑栓塞还可能是因为心肌梗死，心肌梗死也可能导致血液循环淤滞，促使附壁血栓形成，进而引起心源性脑栓塞。此外，心内膜纤维变性、二尖瓣脱垂、心房黏液瘤、先心病或瓣膜手术都可能引起心源性脑栓塞。