在治疗小儿心房颤动时，要明确其发病原因和诱发因素，并针对其原因和诱发因素进行处理。
由于甲亢、甲减、先心病导致的心脏增大等原因，需要采取药物、外科封堵等方法进行处理；肥胖、急性肠胃炎引起的电解质紊乱、植物神经紊乱等都是诱发因素。如果在原发性或诱发因素得到抑制后仍存在房颤，可以使用抗房颤的药物，如果药物的抑制不了，可以考虑进行导管消融。具体的使用方法要根据临床情况，在医师的建议下进行。