通常来说，无法比较静脉血栓和动脉血栓哪个严重。
如果血栓位于静脉血管的主干，如股静脉、腘静脉等，可能会因为血栓脱落，而造成急性肺栓塞，出现猝死等严重的并发症，所以此时静脉血栓比动脉血栓严重。
如果动脉血栓位于动脉的主干，如肠系膜上动脉血栓堵塞，可能会引起全小肠和升结肠坏死，甚至导致感染性休克危及生命，此时动脉血栓更加严重。