羊水穿刺不能检查出先天性心脏病，建议采用染色体缺陷检测。
羊水穿刺可以发现孩子有没有遗传问题，一般诊断为无脑和脊髓裂，同时也可以检测到孩子的肺和肾的发育情况，并且能有效地防止婴儿溶血性。不过，羊水穿刺不能检测到先心病，也不能确定胎儿有没有先天的疾病，如果怀疑有先天性心脏病，则可以通过染色体缺陷检测。