新生儿房室传导阻滞的治疗方法有一般治疗、药物治疗、手术治疗。
对于新生儿房室传导阻滞的治疗要视具体情况而定，轻微的房室传导阻滞不需要治疗，严重的房室传导阻滞要进行长期治疗，去除诱因，积极治疗原病因，同时可以口服阿托品、异丙肾上腺素、氢化可的松等。
手术治疗一般是人工起搏器，在病情严重且药物无效的情况下，可考虑使用心肺起搏器。由于心脏功能不全，造成心脏功能紊乱，造成心脏运动迟缓的临床表现，必须进行永久的心脏起搏。