临床中胃肠功能紊乱和腹泻者，平时可遵医嘱口服止泻药和益生菌，帮助改善肠胃功能紊乱所带来的症状，另外胃肠功能紊乱也会导致其他不适症状出现，可以选择对应的药物来治疗。
1、止泻药：有蒙脱石散和盐酸洛哌丁胺胶囊，可保护肠道黏膜，也可改善腹泻，但是服药期间，药物的副作用应引起重视；
2、益生菌：胃肠功能紊乱可使肠道中的菌群失调而造成腹泻，所以，可用益生菌来调理。若选用双歧杆菌活菌散可调理胃肠道菌群以促进疾病的康复。
另外胃肠功能紊乱也会引起腹胀、反酸和腹痛，病人可以根据医嘱选用多潘立酮片和奥美拉唑肠溶片及马来酸曲美布汀片给予相应的治疗，促进疾病的整体康复。