食管镜检查过程中可能会有一些疼痛，但是这种疼痛是可以忍受的，患者在检查过程中可能会感觉到喉咙处有明显的异物感，从而导致恶心、呕吐等不适，也有一些感觉比较敏感的患者会有疼痛的感觉。在做食管镜检查的时候，医生会给患者缓解疼痛，同时会有麻醉，所以患者不需要太过紧张。
食管镜检查是一种用带有内镜的软管从患者的咽喉部位往下放，一直到食管，是一种用来检查患者是否存在咽喉、食管等部位病变的检测手段。食管镜检查前有麻醉，可以降低患者的感官，减轻患者的疼痛。
在做检查之前，医生会让受检者做深呼吸，放松自己。同时，将食管镜放入口腔一定距离后，嘱咐受检者吞咽，用鼻孔呼吸，尽量减轻痛苦，降低恶心、呕吐等症状。食管镜检查通常只需要几分钟的时间，一般情况下患者的不适症状就会消失。